Türk Medline
Dokran

İRAN'DA RİFAMPİSİNE DİRENÇLİ MYCOBACTERİUM TUBERCULOSİS SUŞLARINDA RPOB KODLAYAN RNA POLYMERASE BETA SUBUNİT MUTASYONLARININ TANIMLANMASI

SAEED ZAKER BOSTANABAD, AHMADREZA BAHRMAND, LEONİD P TITOV, MOHAMMAD TAGHIKHANI

Tuberculosis and Thorax - 2007;55(4):370-377

Belarusian Research Institute for Epidemiology and Microbiology, Minsk, Belarus

 

Bu çalışmanın amacı; İranlı hastalardan izole edilen Mycobacterium tuberculosis suşlarında rpoB mutasyonlarının sıklığı, lokalizasyonu ve tiplerini belirlemekti. Tüberküloz şüphesi olan 91 hastadan balgam örnekleri alındı. M. tuberculosis olarak tanımlananların 34 (%87)'ünde Rif-r izole edildi. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) amplifikasyonu ve DNA sekanslama metotları kullanıldı. rpoB geni 411 bp fragmanları sekanslandı ve 81 bp bölgelerinin mutasyonları incelendi. Yirmi dokuz RIF-r MBT'de (%85) 60 mutasyon ve 13 mikrodelesyon saptandı. Altmış mutasyon içinde altı sessiz ve 54 missens mutasyon belirlendi. Missens mutasyonlar 23 tip aminoasit değişikliğini ortaya çıkardı. Beş RIF-r MBT izolatında (%15) rpoB geni core bölgesinde hiçbir mutasyon saptanmadı. Tüm sessiz mutasyonların 507 numaralı kodonda yerleştiği belirlendi. İranlı suşlarda saptanan mutasyonlar en sık 523 ve 526 numaralı kodonlardaydı. Beş yüz yirmi altı numaralı kodonda 5 allel ve 507, 508 ve 513 numaralı kodonların her birinde üç allelde tripletler bulundu. Altı (%19) suşta 526, 510 numaralı kodonlarda tekli mutasyonlar varken, geri kalan 23 (%69) izolatta multipl mutasyonlar: ikili 11 (%34), üçlü 7 (%22), dörtlü 1 (%3) ve beşli 4 (%12) olduğu belirlendi.